O município de Cuiabá é um dos 13 de Mato Grosso que estão com risco alto de contaminação pelo coronavírus. De acordo com o Painel Epidemiológico divulgado pelo Governo do Estado, Cuiabá possui 2.958 casos ativos de Covid-19, o maior número no Estado. Além de Cuiabá também estão na lista os municípios de Rondonópolis, Várzea Grande, Primavera do Leste, Sinop, Nova Xavantina, Sorriso, Barra do Garças, Poconé, Cáceres, Pontes e Lacerda, Nova Mutum e Cotriguaçu. O sistema de classificação que aponta o nível de risco é definido por cores: muito alto (vermelho), alto (laranja), moderado (amarelo) e baixo (verde). De acordo com a definição dos riscos, é necessária a adoção de medidas restritivas para o controle da propagação do coronavírus nas cidades.